BNCT有著理想的理论基础，然其亦有必须面对的现实层面及临床考量:

　　一、有效含硼药物的获得(必须具特异性肿瘤内积聚能力):

　　早期之BNCT 研究发现必须有效使硼-10 药物能专一地为肿瘤细胞所摄取，才能发挥其特殊破坏肿瘤而不伤害正常组织之特性，因此多年来，研究工作者极力研发有效之相关含硼-10 药物，以增进BNCT 的反应性。另外，肿瘤细胞内浓度与正常组织细胞浓度间之比率必须达三倍以上，否则BNCT反应相较不明显，因此凸显如何产生特异性肿瘤摄取含硼药物之问题性，相关国际临床学者尝试研发以动脉给药、溶脂体(liposome)等方式以提升肿瘤内含硼药物浓度来增加BNCT反应，并避免周边组织因反应所产生之伤害性。另外由于现今核医技术成熟突破发展，在执行BNCT前亦可利用合成之具放射同位素之18F-BPA为示踪剂，透过正子摄影(PET)方式来侦测病人体内BPA之真实含量分布状况，可以有效评估BNCT治疗之可行性并掌握治疗后之疗效性。

　　二、有效中子来源:

　　BNCT是种二元性(binary)治疗法，在克服含硼药物之药物问题后，则必须考虑有效之中子射源，而这射源往往必须透过原子反应器的协助方能有效达成，有效的中子射源含盖其相关品质及能量，能量及通量(flux)不足之中子源无法穿透人体组织对于深部肿瘤提供有效之照射。过往由于中子源技术关係，曾经一度发展开颅后中子照射之BNCT脑瘤治疗方式(intra-operative BNCT)，但近年来由于核子工程技术突破，足以提供高能中子射出技术，该等治疗方式已罕为执行。 国际间目前使用于BNCT研究或临床治疗的反应器包括有美国麻省理工学院反应器(MITR)，瑞典Studsvik的Medical AB，芬兰赫尔辛基之FiR1(芬兰以国家政府力量投入成立完善之BNCT公司组织BONECA，提供包括药物研发，反应器营运及临床试验研究)，荷兰Petten之R2-0，捷克Rez的LVR-15，日本京都大学原子炉试验所之KUR及日本原子力研究开发机搆(JAEA)之JRR-4(日本国内具有完整临床暨基础研究之BNCT学会，为国际间相对BNCT研究较为成熟之国家)，阿根廷Bariloche之RA-6，另外在义大利，韩国以及中国大陆等亦有相关反应器设施运作BNCT。 台湾新竹清华大学亦具有一设备符合世界等级之反应器THOR(Tsing Hua Open-Pool Reactor)，在清华大学相关核子工程教授的研究发展下亦是具有潜力提供高品质BNCT之肿瘤医疗环境。

　　虽然在原子反应器的协助下可以有效提供执行BNCT所需之中子源，然庞大之反应器设施由于核子管理的严格性并不是适合医院运作之设备，因此国际间亦有新的观念及想法，希望能研发设备较为精简之中子射源，如透过迴旋加速器(cyclotron)来产生有效之热中子来源。目前于日本京都大学原子炉试验中心即安置有世界首座由住友重工业公司（Sumitomo Heavy Industry Ltd）所设计製造之迴旋加速器，透过利用质子撞击铍靶(Beryllium)来产生中子源，其在Koji Ono(小野 公二)教授主导下，已进入前临床试验尾声，预计将正式进入临床治疗，这项突破如果可以顺利运行，则将来可协助于以医院为基础设置该等较为精简设施以利执行BNCT之临床治疗。